Fondé vers 950 par des moines de Cluny, le prieuré de Salles est l’un des plus anciens du Beaujolais. En 1301, la puissante abbaye de Cluny installe à Salles une communauté de femmes, qui deviendra rapidement prospère. Au fil des siècles, la communauté va progressivement gagner en indépendance.
Au cours du XVIIIe siècle, les sœurs bénédictines abandonnent la tutelle clunisienne pour se placer sous l’autorité de l’archevêque de Lyon. La communauté évolue et les religieuses finissent par quitter leur vie cloîtrée au profit d’une vie mi-religieuse, mi-mondaine pour devenir le Chapitre noble de chanoinesses-comtesses. Les femmes, pour la plupart issues des grandes familles locales, se construisent les petites maisons individuelles que l’on peut encore voir aujourd’hui autour du parterre du chapitre.
L’église et le cloître actuels ont conservé leur caractère roman des XIe et XIIe siècles et offrent au visiteur un espace empreint de quiétude et de poésie.